在国家863计划支持下，我国优质特色肉牛分子辅助选择技术取得重要进展，提出了改进现行育种规划的措施，建立了优质特色肉牛选育与扩繁最优化方案。

　　对影响鲁西牛、南阳牛、秦川牛群体中生长发育性状的候选基因进行了初步研究，发现生长激素基因对肉牛的生长发育性状有显著作用。利用8对微卫星DNA位点对5个品种牛的等位基因、杂合度、遗传距离等进行了遗传检测，对草原红牛肉用性状基因标记、延边黄牛的分子遗传结构及微卫星DNA指纹分析、延边黄牛血液蛋白多态、染色体核型分析进行了研究，发现了一些与肉用性能相关的遗传标记。在常规育种的基础上，超声波活体测膘技术以及分子标记辅助育种，形成三位一体的现代肉牛育种技术新体系，已被用于优质肉牛基础群、核心群的建立以及新品系的早期选育、扩繁和规范化生产。

　　建立了用于个体间亲缘关系评估及女儿数进行校正的计算机程序，并利用ZUPLAN软件研究了鲁西黄牛核心群优化育种规划，初步创立了不同种群（品种、物种）结构基因核苷酸序列进化距离分析的“广义对位排列”方法，并应用于优质鲁西肉牛新品系的选育实践。初步建立草原红牛和延边黄牛肉用新品系核心群，建立了基因标记与早期选种应用、性能测定与肉质评定，规模育肥与生产技术相结合的优质特色肉牛选育与扩繁技术规范。建立了秦川牛线性评定和BPI，结合生物学、统计学、信息论制定了综合选择指标，开展双胎性状的分子遗传学研究，开展了秦川牛新品系规模育肥技术示范，年出栏育肥牛2万头以上，其中优质育肥牛1万头以上。